組織架構圖：

綜合規劃組 主政機關： 昆明防治中心 協辦機關： 衛生局、教育局、觀光傳播局、民政局、產業發展局、社會局、警察局、兵役局、勞動局 預防宣導組 主政機關： 教育局 協辦機關： 衛生局、 觀光傳播局、 民政局、 產業發展局、 社會局、 警察局、 兵役局、 勞動局 保護扶助組 主政機關： 昆明防治中心 協辦機關： 社會局、勞動局 轉介服務組 主政機關： 昆明防治中心 協辦機關： 衛生局、社會局、勞動局、教育局、警察局 危害防制組 主政機關： 警察局 臺北市政府毒品危害防制中心 主 任：由市長兼任 副 主 任：由市長指派之副市長兼任 執 行 長：由市長指派之副秘書長兼任 副執行長：由昆明防治中心負責人兼任 諮詢委員：臺灣臺北地方法院檢察署檢察官一人、 臺灣士林地方法院檢察署檢察官一人、 毒品防制相關專家學者三至五人， 共五至七人